株式公開 2026-10-20 ・ 更新 2026-10-20

特定口座の源泉徴収あり・なし。申告が要るのはどんな時？

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「源泉徴収あり」の特定口座なら、株で利益が出ても税は自動で引かれ、確定申告もしなくて済みます。ただし別の証券会社に損が出ているなら、申告したほうが得になることがあります。仮の人の計算では、約6.1万円の差でした。

結論は短いです。申告が要るかどうかは、口座の種類より「ほかに損益があるか」で決まります。国税庁の原文を開いて、あり・なしの違いと、申告が要る場合を整理しました。

書いている私は、売買ロジックを100以上検証してきたシステムエンジニアです。FP1級の資格は持っていますが税理士ではなく、個別の税額計算や申告の代行はしていません。国税庁の原文を開いて確かめた内容だけを書きます。

先に1分チェック

1. 証券口座は1社だけですか、複数ですか。複数あるなら、会社をまたいだ損益の合算は自動ではされません
2. 今年、どこかの口座で損が出ていますか。出ているなら、別の口座の利益と相殺できる場合があります
3. 口座は「源泉徴収あり」ですか。年の最初の売却までに選ぶ決まりで、年の途中では変えられません

あり・なしの違いは「税を誰が計算するか」

国税庁の説明では、特定口座は2種類あります。

国税庁 タックスアンサー No.1476「特定口座制度」。2026年10月20日確認（令和8年4月1日現在法令等）

表を見ると、「あり」を選んでおけば、ふつうは何もしなくて済みます。手間を省きたいだけなら、これで足ります。簡単です。

では、どんな時に「しなくて済む」が崩れるのか。原文にある条件は3つでした。

申告が要る場合は3つ

国税庁は、源泉徴収ありの口座でも申告が必要になる（または申告して初めて特例が使える）場合として、次を挙げています。

• ほかの口座の損益と合算したい。源泉徴収口座の損益を、別の口座の上場株式等の損益と相殺するとき
• 損失の繰越控除を使いたい。上場株式等の譲渡損失を、配当などと損益通算し、さらに翌年以降へ繰り越す特例（No.1474）を受けるとき
• 口座内の損失を申告したい。この場合、受け取った配当も一緒に申告しなければなりません

1つ目が、いちばん起きやすい場面です。次の計算で、どれくらい差が出るかを見ます。

計算してみた：A社で益40万円、B社で損30万円

仮の人です。A証券（源泉徴収あり）で利益40万円、B証券（源泉徴収あり）で損失30万円。ほかに株の取引はなく、税率は国税庁の15.315%と住民税5%（合計20.315%）で考えます。

筆者の計算。税率は国税庁 No.1476 の15.315%（所得税・復興特別所得税）と住民税5%。端数は円未満を切り捨て。他の所得や控除は考えていません

申告しなかった場合、B社の損30万円は誰にも数えられません。A社が引いた税もそのままです。申告すれば、引かれすぎた分が戻ります。

この「戻る」の部分は質問2、自分が損する場合は書いてあるかの典型です。証券会社の画面には、「申告すると得かもしれない」とは出ません。自分で気づく所です。

損する場合・向かない人

• 申告が面倒で、損益が1社だけの人。合算する相手がないので、「あり」で申告不要のままでよい場合が多いです
• 「あり」を選んだあとで、やめたくなった人。選択は年単位で、年の途中の変更はできません（国税庁）
• 損を申告したい人。配当も一緒に申告になるので、配当のほうに税がかかる点は先に見ておきます
• 新NISA口座の損益。NISA口座の損は、特定口座の利益とは合算できません。ここで書いたのは特定口座どうしの話です

私ならこうする

書き手

私なら、年末に全部の証券会社の年間の損益を並べます。1社しか使っていないなら、「あり」のまま放っておきます。

複数の会社で売買していて、片方に損があるなら、その年の確定申告を検討します。手順は副業の確定申告のやり方と同じ流れで、e-Taxに株の欄があります。損が大きいときの繰り越しは、株の損失を3年繰り越す仕組みに書きました。

手数料まわりの考え方は株の売買手数料が無料の仕組みで読めます。口座を増やす前に、損益が分かれる点も頭に入れておくといいです。

この記事でわからないこと

• 申告で所得が増えたとき、国民健康保険料や扶養の判定、各種給付にどう響くか。自治体と制度で違い、今日は原文を開いていません
• 2027年以降の源泉徴収。国税庁は、令和9年1月1日以後の所得から復興特別所得税の税率が1.1%に下がり、防衛特別所得税が併せて源泉徴収されると書いています。引かれる総額への影響の計算はしていません
• どの証券会社がよいか。比べていませんし、すすめません

お金を動かす前に、1つだけ確かめる。今回は、いま使っている証券口座が「あり」か「なし」かです。口座の管理画面で見られます。

あなたの口座は、複数の会社にまたがっていますか？

国税庁 タックスアンサー No.1476「特定口座制度」、No.1463を2026年10月20日に確認しました（令和8年4月1日現在法令等）。制度の一般的な説明で、個別の税務・投資の助言ではありません。